职能部门党委是学校在职能部门设置的二级党委，是联系各职能部门及其挂靠单位的桥梁和纽带，主要负责职能部门党的思想建设、组织建设、作风建设和精神文明建设等各项工作，为各职能部门开展日常业务提供组织保障。

目前，职能部门党委所属的处级部门有32个，下设23个党支部，共有365名党员。

职能部门党委有在岗工作人员4名，其中，1名常务副书记，1名副书记兼纪委书记，2名科长。

办公地点：云南农业大学东校区耕读楼327室

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